Pruebas genéticas para los desordenes primarios de la inmunodeficiencia

¿POR QUÉ ES IMPORTANTE ESTABLECER UNA DIAGNOSIS MOLECULAR EN DESORDENES PRIMARIOS DE LA INMUNODEFICIENCIA?
A: Esta información permite que los proveedores de asistencia sanitaria informen mejor a individuos y a las familias afectados sobre pronóstico y estrategias óptimas de la vigilancia, y puede también dirigir terapia. Por ejemplo, los pacientes con inmunodeficiencia combinada severa pudieron tener fenotipos similares aunque tienen variantes en diversos genes. Conociendo qué gen es afectado ayudas determine si la mejor opción del tratamiento pudo ser terapia del reemplazo de la enzima, terapia génica, o un trasplante de la célula madre.
Además, una vez que se establece la diagnosis molecular, los proveedores de asistencia sanitaria pueden definir mejor el riesgo de repetición y decidir si defender a los miembros de la familia inafectados para la situación del portador, para identificar a un donante conveniente de la célula madre, o para otros fines.
¿CÓMO EL ACERCAMIENTO DE DIAGNÓSTICO A LOS DESORDENES DE LA INMUNODEFICIENCIA HA CAMBIADO ESTOS ÚLTIMOS AÑOS?
Históricamente, cuando un paciente presentado con una historia clínica sospechosa para una inmunodeficiencia primaria, el proceso de diagnóstico comenzó con una evaluación inmunológica básica y estudios funcionales subsiguientes a identificar el defecto inmunológico específico. Entonces, después de estrechar la diagnosis diferenciada o de hacer una diagnosis clínica, los laboratorios pudieron haber realizado estudios genéticos, si están disponibles, para establecer una diagnosis molecular.
Sin embargo, la heterogeneidad clínica y genética de algunos desordenes primarios de la inmunodeficiencia puede hacer este desafiar del acercamiento. El espectro fenotípico es muy amplio para algunos desordenes, dando por resultado el mismo defecto molecular que presenta muy diferentemente entre individuos. Además, dado la naturaleza rara de algunos de estos desordenes, un paciente pudo presentar con un fenotipo que no se caracteriza todavía completamente. Estos escenarios pueden hacerlo difícil seleccionar para ordenar los genes muy probablemente para causar enfermedad. Si un laboratorio ordena genes individuales múltiples por separado, la prueba puede también ser costada prohibitivo cuando el trabajo-para arriba inmunológico no estrecha la diagnosis a un o algún genes.
Con avances en tecnología, las pruebas genéticas han disminuido drástico en coste y han estado más extensamente - disponibles. Particularmente, la introducción masivo de paralelo o la siguiente generación que ordenaba (NGS) ha dado a laboratorios una manera económicamente posible de probar muchos genes simultáneamente, que los contrastes con Sanger tradicional que ordena los acercamientos que prueban típicamente solamente uno o algunos genes a la vez. Estos avances, ahora disponibles en ajustes clínicos, han llevado a un “genotipo-primer” acercamiento alterno a la diagnosis de los desordenes de la inmunodeficiencia. Además, las pruebas genéticas extensas han dado lugar a un aumento rápido en la identificación de los desordenes monogenic de la inmunodeficiencia.
¿QUÉ ACERCAMIENTO DE LA PRUEBA DE NGS EL MÁS APROPIADO PARA LA INMUNODEFICIENCIA DISORDERS-A APUNTÓ EL PANEL O EXOME ESTÁ ORDENANDO?
Hay pros - y - contra a ambos acercamientos. Los paneles apuntados prueban una lista experto curated de genes asociados a la enfermedad del interés y pueden incluir variantes en los exones y las variantes sabidas situadas en regiones de la no-codificación. Los estos paneles pueden también implicar los métodos complementarios para los genes difíciles probar por NGS. Sin embargo, es desafiador para que los laboratorios mantengan los paneles apuntados puestos al día como genes adicionales llega a ser asociado con enfermedad. Exome que ordenaba, que tiende a ser más costoso y tiene un tiempo de vuelta más largo, no pudo incluir las variantes importantes de la no-codificación o los genes dominantes que no son favorables a NGS. Sin embargo, la secuencia del exome permite el descubrimiento de genes enfermedad-asociados adicionales y pudo ser más conveniente para los individuos con un fenotipo no específico que pudo requerir de otra manera los paneles apuntados múltiplo.
¿HAY LIMITACIONES A LA DIAGNOSIS GENÉTICA?
A pesar de avances en la prueba, los laboratorios todavía no pueden alcanzar una diagnosis genética para todos los pacientes. Esto puede ser debido a un gen que todavía no se ha asociado a enfermedad, herencia oligogénica o poligénica, epigenetics, u otras variables. Los proveedores de asistencia sanitaria deben por lo tanto continuar integrando la información genética con historia clínica y estudios funcionales al hacer una diagnosis. Esto requiere la colaboración cercana entre los clínicos y los profesionales del laboratorio.